作為JMP Genomics產品經理,我很高興地宣布JMP Genomics 3.0已經完成併計劃於5月底發布。我們一流的開發,測試,文檔和支持團隊的出色工作為如何使用它們提供了一些出色的新功能和指導。自從去年年底發布我們的2.0.4網站更新以來,已經完成的新工作量讓我感到驚訝。隨著3.0發布日期即將來臨,我們已經在考慮下一次更新了。但首先,讓我先說一下即將推出的3.0版本。
自2006年3月首次發布以來,JMP Genomics在功能和外觀方面取得了長足的進步。通過搭乘新的JMP 7平台,JMP Genomics 3.0提供了漂亮的新3D圖形,包括用戶要求的3-D PCA圖(謝謝你,CH)。您可以在新封面的封面上看到突出顯示的三維圖形 sascom雜誌特刊 ,其中包含JMP。我們的許多現有流程已得到增強,可以使用新的3-D圖形。我們的基因組學菜單中也有一些漂亮的新圖標(謝謝GM,GM!)。
JMP Genomics 3.0通過新功能和增強功能解決了許多用戶請求。簡化的遺傳學工具支持非常大的全基因組關聯研究,並且我們添加了新的SNP-SNP和SNP-trait交互發現功能。我們新的Workflow Builder流程允許用戶將常用的JMP Genomics分析設置鏈接到可重複使用的工作流程。新的估算構建器允許點擊創建估算語句,以便與我們的ANOVA和混合模型流程一起使用。新的UCSC Genome瀏覽器鏈接過程創建鏈接表,並允許用戶指定變量以創建自定義軌道以上載到瀏覽器,以顯示在基因組上下文中使用JMP Genomics獲得的統計結果。我們對JMP Genomics 3.0的增強預測建模功能和新的交叉驗證模型比較(CVMC)平台感到非常興奮,該平台用於比較相同數據集上不同交叉驗證預測模型的性能。我們的開發和測試團隊已經在為MicroArray質量控制聯盟召開的第7次會議上為CVMC做了一次準備工作,這次會議由來自全國各地的150名科學家組成,他們將於5月24日至25日在SAS會面。
說到會議, JMP用戶大會計劃於6月12日至13日在卡里舉行,並於6月11日星期一舉行一些會前JMP基因組學培訓;星期二下午的基因組學追踪;併計劃在周三下午舉辦一次先進的JMP基因組學研討會。隨著關於JMP 7的熱烈討論,用戶會議將非常令人興奮,我們期待著歡迎來自我們的合作夥伴Ingenuity Systems的代表,他們是Ingenuity Pathways Analysis(IPA)的開發者。我們的IPA上傳流程首次在JMP Genomics 2.0.4中展示,允許用戶將基因列表直接從JMP Genomics上傳到IPA Web應用程序中,以進行路徑分析和功能註釋。JMP Genomics的其他合作夥伴公司現在包括Affymetrix和Illumina,它們為我們的用戶提供生成表達的工具和要分析的SNP數據。
我想再次感謝用戶的建議和支持,感謝JMP和JMP Genomics團隊在JMP Genomics 3.0上長時間工作。如果您是對我們下次更新有想法或建議的用戶,我們希望您通過電子郵件發送給他們 genomics@jmp.com 。謝謝!