매 릴리스주기마다 JMP Genomics 개발 팀은 새로운 데이터 형식에 대한 지원을 추가하고 기존 형식의 가져 오기 프로세스를 최신 형식으로 업데이트합니다. 우리는 차세대 시퀀싱 연구 및 마이크로 어레이 실험에서 여러 유형의 원시 또는 요약 데이터 파일을 가져올 수 있습니다.
이러한 파일은 JMP Genomics로 가져와 다음 파일로 저장됩니다. SAS 품질 관리, 표준화, 모델링, 패턴 발견 및 예측 모델링 도구로 검사 할 수있는 데이터 세트. 확실히 방문할만한 가치가 있습니다. JMP 생명 과학 자원 사이트 지원되는 다양한 파일 형식의 가져 오기를 검토하는 업데이트 된 단계별 가이드를 다운로드하십시오. 자세한 문서는 소프트웨어 내의 모든 가져 오기 프로세스에서도 사용할 수 있습니다.
JMP Genomics 6을 개발하는 동안 우리는 게놈 기능 내의 정렬 된 읽기 수를 계산할 목적으로 더 큰 SAM 또는 BAM 파일 세트를 가져 오는 고객과 협력 해 왔습니다. 결과적으로이 릴리스의 계산 알고리즘 성능이 크게 향상되었습니다. 일련의 SAM 또는 BAM 파일을 가져온 후에는 RPM 및 RPKM 값뿐만 아니라 기능 수준에서 원시 카운트를 제공합니다. 이러한 요약 데이터 세트는 Basic RNA-seq Workflow를 포함한 RNA-seq 데이터에 대한 통계 도구를 사용하여 평가, 표준화 및 분석 할 수 있습니다.
VCF 파일 가져 오기 프로세스가 향상되어 깊이와 유전자형 품질을 기반으로 출력 데이터 세트에서 유전자형 또는 변형을 제외 할 수있는 새로운 필터가 추가되었습니다. 우리는 Complete Genomics의 지원을 추가했습니다. 시험 변이체 이전 버전의 ASM 폴더에서 여러 개의 개별 변형 파일을 가져 와서 결합하는 옵션을 유지하면서 파이프 라인 출력 파일을 보호합니다. JMP Genomics 6는 바이너리 Plink 파일을 가져와 두 프로그램 모두에서 작업하거나 Plink 사용자와 공동 작업하는 고객을보다 잘 지원할 수 있습니다. 우리는 여러 버전의 Plink 텍스트 파일을 가져 왔지만 이제는 광범위한 PED / BIM / FAM 파일 집합을 JMP Genomics로 가져와 추가 분석을 할 수 있습니다. 유전 분석 도구 .
원시 데이터 유형을 가져올 때 JMP Genomics 6에 구현 된 새로운 학습 구조를 활용하여 관련 데이터 세트의 구성을 단순화 할 수 있습니다. 가져 오기 중에 새 스터디를 만들거나 새로 가져온 데이터를 기존 스터디에 추가 할 수 있습니다. 연구 프레임 워크 내에서 작업하면 다양한 유형의 설정 및 데이터 세트 (예 : 폭이 넓거나 키가 큰 데이터 세트, 주석 파일)의 선택이 상당히 간소화됩니다. 같은 샘플에 대해 생성 된 마이크로 어레이, RNA-seq 카운트 또는 변형 데이터 세트로 작업하는 연구 내에서 데이터 유형을 혼합하고 일치시킬 수 있습니다. 구조는 매우 유연합니다!
현재 JMP Genomics 6에서 지원하는 데이터 유형에 대한 개요는 제품 요약을 참조하십시오. 이리 . 이 릴리스의 새로운 기능에 대한 기술 정보는 릴리스 정보를 참조하십시오. 이리 . 소프트웨어가 향후 릴리스에서 추가 입력 유형을 지원하는 데 관심이 있으시면 언제든지 Shannon dot conner에서 jmp dot co.kr에서 나에게 이메일을 보내 주시기 바랍니다.
