農作物を改良するためのJMP®ゲノミクスにおける連鎖地図の最適化 農作物を改良するためのJMP®ゲノミクスにおける連鎖地図の最適化
Kelci MiclausおよびRebekah Oliver、SAS Institute Inc。エリックジャクソン、USDA-ARS
遺伝マーカーを互いに位置関係に配置するうまく構築された連鎖地図は、多くの動植物種における量的形質遺伝子座（QTL）分析において重要である。遺伝的に遺伝した形質にDNAマーカーを関連づけることは、病害抵抗性の改善および収量の増加などの望ましい形質を有する植物を選択するためにマーカー支援育種アプローチを使用することを可能にすることによって農作物研究の効率を改善する。連鎖地図は、既知の家系の実験集団からのサンプルについてのＤＮＡマーカー遺伝子型を用いて構築される。マーカーは、それらの組換え率によって測定されるように、それらがいかに密接に関連しているかに基づいて連鎖グループに割り当てられる。グループ内のマーカーの最適な順序は、最短遺伝距離マップを計算するために決定されます。JMP Genomics 5.1の新機能は、SAS / ORのPROC OPTMODELの最適化ルーチンを使用して、連鎖グループを計算し、最適に順序付けられたマーカーマップを決定します。私達は共同Oat Research Enterprise（CORE）による進行中の研究の一部として組換え近交系から得られたエンバク植物からのDNAマーカーの分析でこれらの新しい特徴を強調する。
データ調査
