JMP®基因組學中的連鎖圖優化改善農作物 JMP®基因組學中的連鎖圖優化改善農作物
SAS Institute Inc.的Kelci Miclaus和Rebekah Oliver;和Eric Jackson，USDA-ARS
在許多植物和動物物種的數量性狀基因座（QTL）分析中，將遺傳標記相對於彼此放置的良好構建的連鎖圖譜是關鍵的。將DNA標記與遺傳性狀相關聯通過允許標記輔助育種方法用於選擇具有期望性狀的植物（例如改善的抗病性和增加的產量）來提高農藝作物研究的效率。使用來自已知譜系的實驗群體的樣品的DNA標記基因型構建連鎖圖譜。根據它們的重組率來衡量，標記根據它們的連接密切程度分配給連鎖組。確定組內標記的最佳順序以計算最短遺傳距離圖。JMP Genomics 5.1中的新功能使用SAS / OR的PROC OPTMODEL中的優化程序計算連鎖組並確定最佳排序的標記圖。作為合作燕麥研究企業（CORE）正在進行的研究的一部分，我們在分析來自重組近交系的燕麥植物的DNA標記中突出了這些新特徵。
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