마우스 근육에 이식 된 금속 펠렛의 대규모, 다중 치료, 시간 코스 연구에 대한 통계적 접근법
Wenjun Bao, Russell D. Wolfinger, Tzu-Ming Chu, SAS; Edward Perkins, 미 육군 기술자 연구 개발 센터; Desmond I. Bannon, 공중 보건 연구소
생쥐에서 단일 이식 펠릿 (니켈, 텅스텐 / 니켈 / 코발트 합금, 탄탈륨 또는 대조군)의 효과에 대한 시간 경과 연구에서 400 이상의 Illumina Sentrix MouseRef-8 v1.1 발현 비드 칩 어레이가 생성되어 시간 경과에 따른 유전자 발현 프로파일에 대한 치료의 효과. 이러한 대규모 데이터 세트와 관련된 몇 가지 데이터 분석 과제에 대한 솔루션을 제시합니다. 첫째, 형질 전환 : 음의 강도 값을 가진 상당수의 유전자가있다. 우리는 이동 된 로그 및 누락 값 대체 접근법을 조사했습니다. 둘째, 정상화 : microarray 샘플 준비 완료 날짜와 관련된 확실한 배치 효과가 있습니다. Grouped-Batch Profile (GBP) 수정을 포함하여 다른 표준화 방법을 연구했습니다. 셋째, 차별적으로 발현 된 유전자 : 우리는 그들의 차이를 테스트하기 위해 혼합 모델 ANOVA 접근법을 사용했다.
