マウス筋肉に植え込まれた金属ペレットの大規模な多重治療の経時的研究を分析するための統計的アプローチ
Wenjun Bao、Russell D. Wolfinger、そしてTzu-Ming Chu、SAS。エドワードパーキンス、米陸軍エンジニア研究開発センター。デズモンドI.バノン、公衆衛生研究所
マウスへの単一注入ペレット（ニッケル、タングステン/ニッケル/コバルト合金、タンタル、またはコントロール）の効果の経時的研究では、400以上のIllumina Sentrix MouseRef-8 v1.1発現ビーズチップアレイが評価された経時的な遺伝子発現プロファイルに対する処理の効果。このような大規模データセットに関連するいくつかのデータ分析の課題に対する解決策を示します。第一に、形質転換：強度値が負の遺伝子がかなりの数あります。我々はシフトした対数と欠損値の代入アプローチを調べた。第二に、正規化：マイクロアレイサンプル調製完了日に関連する明らかなバッチ効果がある。グループ化バッチプロファイル（GBP）補正を含むさまざまな正規化方法を調べました。第三に、差次的に発現される遺伝子：我々はそれらの違いを試験するために混合モデルＡＮＯＶＡアプローチを使用した。
