에이 새로 녹음 된 웹 캐스트 기존 귀리 품종 개량에 초점을 맞춘 컨소시엄 연구자의 작업을 강조하는 내용이 이제는 웹 사이트에서 제공됩니다. 기록 된 웹 캐스트에는 미 농무부 (USDA)의 연구 분자 생물학자인 Eric Jackson 박사의 발표와 함께 세계 공동 작물 인 귀리 연구 기업 (CORE)의 작업에 대한 발표와 함께 몇 가지 기능에 대한 시연이 포함되어 있습니다 ...에서 JMP Genomics 5.1 올 가을.
에서 주문형 웹 캐스트 Eric은 마커 보조 육종 기술에 대해 논의하고 귀리 곡물 섬유를 제어하는 새로운 유전자의 발견을 이끌어 낸 작업을 공유합니다. CORE 팀은 복잡한 귀리 게놈의 마커에 대한 지식을 향상시키고 향후 육종 프로그램에 사용할 예측 분석을 개발하기 위해 높은 처리량의 유전체학 접근법을 사용했습니다. Eric은 JMP Genomics를 사용하여 CORE의 결과에 기여한 일부 분석을 수행했습니다.
이 웹 캐스트에는 JMP Life Sciences Specialist Jordan Hiller의 새로운 Recombination and Linkage Groups, Linkage Map Order 및 Linkage Map Viewer 프로세스에 대한 발표가 있습니다.
이 새로운 기능은 USDA를 비롯한 여러 대형 JMP Genomics 라이센스 사이트의 요청에 따라 추가되었습니다. 우리는 이러한 새로운 기능을 실현하기 위해 우리와 협력하고자하는 Eric과 같은 사용자들의 협조에 진심으로 감사드립니다. 현재 작업 흐름, 실제 데이터 세트에 대한 정보를 공유하고 프로토 타입 개선을위한 제안을 기꺼이하고자하는 고객과 함께 작업하는 것이 이상적인 상황입니다. 수많은 JMP Genomics 프로세스와 마찬가지로이 새로운 도구는 JMP 처리 능력은 SAS 무대 뒤에서.
우리의 새로운 기능은 연계지도 공간에서 많은 사용자의 요구를 충족한다고 믿습니다. 재조합 및 연결 그룹 프로세스는 몇 가지 일반적인 유형의 실험 교차에 대한 재조합 분수를 추정하고 처음부터 새 맵을 작성할 때 사용할 연결 그룹의 초기 세트를 결정합니다. 기존지도를 시각화하는 데 관심이 있다면 Linkage Map Viewer의 3D 그래픽을 좋아할 것입니다.
합의 링크 그룹이 이미 확인 된 경우 링크 맵 주문에있는 링크 그룹을 사용하여 미리 정의 된 그룹 내에서 순서를 수행 할 수 있습니다. Linkage Map Order에는 PROC MDS에서 다차원 스케일링 메소드를 호출하는 표준 마커 순서 지정 알고리즘이 있습니다. 그러나 라디오 버튼을 클릭하면 라이센스가있는 JMP Genomics 사용자 SAS / OR SAS PROC OPTMODEL의 고급 마커 순서 최적화 방법을 이용할 수 있습니다. 마지막으로 JMP의 그래프 빌더와 같은 대화식 도구를 사용하여 기존 맵과 JMP Genomics 내에 빌드 된 새 맵 간의 주문을 비교할 수 있습니다.
보고있는 후 Eric의 웹 캐스트와 Jordan의 데모 새로운 기능에 대한 의견을 보내주십시오. 우리는 다음 버전 인 JMP Genomics 6을 위해이 영역과 다른 영역에서 요구 사항을 모으고 있습니다. JMP Genomics 6은 내년에 JMP 10 플랫폼에서 발표 될 예정입니다. JMP Genomics 5.1에 대한 새로운 기능 웹 캐스트가 여름에있을 예정입니다. 녹화 된 웹 캐스트에 대한 의견이 있거나 기존 사용자인데 올 예정일을 미리보기 위해 기다릴 수없는 경우에는 genomics@jmp.com .
식물 및 동물 게놈 회의에서의 JMP 유전체학 쓴 :
[...] USDA-ARS의 JMP 챔피언 인 Eric Jackson과의 협력 덕분에 우리는 JMP Genomics 개발 팀의 노력으로 급속한 발전을 이루었습니다 [...]
사용자가 소프트웨어 개발 프로세스의 파트너 인 경우 좋은 일이 발생합니다. - JMP 블로그 쓴 :
[...] 내가 Eric의 웹 캐스트와 새로운 [...]에 관해 쓴 이전 블로그 게시물을 확인해보십시오.
