UNA nuevo webcast grabado que destaca el trabajo de un consorcio de investigadores centrado en mejorar las variedades de avena existentes que ahora está disponible en nuestro sitio web. El webcast grabado incluye una presentación del Dr. Eric Jackson, Biólogo Molecular de Investigación para el Departamento de Agricultura de los Estados Unidos (USDA), sobre el trabajo de la Empresa de Investigación de Avena Colaborativa global (CORE), así como una demostración de algunas de las características que se presentarán. en JMP Genomics 5.1 este otoño.
En el webcast a pedido , Eric analiza las técnicas de reproducción asistida por marcadores y comparte el trabajo que llevó al descubrimiento de nuevos genes que controlan la fibra del grano de avena. El equipo de CORE utilizó enfoques genómicos de alto rendimiento para mejorar el conocimiento sobre los marcadores en el complejo genoma de la avena y desarrollar ensayos predictivos para su uso en futuros programas de mejoramiento. Eric usó JMP Genomics para realizar algunos de los análisis que contribuyeron a los hallazgos del CORE.
El webcast también presenta una presentación del especialista en ciencias de la vida de JMP, Jordan Hiller, sobre los nuevos procesos de Recombinación y Grupos de Enlace, Orden de Mapa de Enlace y Visor de Mapa de Enlace que aparecerán en nuestra próxima versión.
Estas nuevas funciones se agregaron a pedido de varios sitios de licencias de JMP Genomics, incluido el USDA. Apreciamos enormemente la cooperación de usuarios como Eric que estuvieron dispuestos a trabajar con nosotros para hacer que estas nuevas funciones sucedan. Es una situación ideal trabajar con clientes que están dispuestos a compartir información sobre sus flujos de trabajo actuales, conjuntos de datos reales y hacer sugerencias para mejorar los prototipos. Como tantos otros procesos de JMP Genomics, estas nuevas herramientas combinan las capacidades interactivas de JMP con el poder de procesamiento de SAS entre bastidores.
Creemos que nuestras nuevas características cubren muchas necesidades de los usuarios en el espacio del mapa de vinculación. El proceso de grupos de enlace y recombinación puede estimar las fracciones de recombinación para varios tipos comunes de cruces experimentales y determina un conjunto inicial de grupos de enlace para usar al crear nuevos mapas desde cero. Si solo está interesado en visualizar los mapas existentes, le encantarán los gráficos 3D del Visor de mapas de Linkage.
Si ya tiene grupos de enlace de consenso identificados, simplemente puede utilizar aquellos en Orden de mapa de enlace para realizar el pedido dentro de los grupos predefinidos. Linkage Map Order presenta un algoritmo estándar de ordenación de marcadores que llama a métodos de escalamiento multidimensional en PROC MDS. Sin embargo, con el clic de un botón de opción, los usuarios de JMP Genomics que también licencian SAS / OR Puede aprovechar los métodos avanzados de optimización de orden de marcadores en SAS PROC OPTMODEL. Finalmente, puede comparar los pedidos entre los mapas existentes y los nuevos construidos en JMP Genomics utilizando herramientas interactivas como Graph Builder en JMP.
Después de ver Webcast de Eric y demo de Jordan , háganos saber sus comentarios sobre la nueva funcionalidad. Estamos reuniendo requisitos en esta y otras áreas para la próxima versión, JMP Genomics 6, que se lanzará el próximo año en la próxima plataforma JMP 10. Tendremos un nuevo webcast de funciones para JMP Genomics 5.1 más adelante en el verano. Si tiene comentarios sobre el webcast grabado, o es un usuario existente y no puede esperar para ver una vista previa de lo que se avecina, comuníquese con nosotros al genomics@jmp.com .
JMP Genomics en la reunión de genomas de plantas y animales escribió:
[...] gracias a la colaboración con el campeón de JMP Eric Jackson de USDA-ARS, y a los esfuerzos de nuestro equipo de desarrollo de JMP Genomics, hemos avanzado rápidamente [...]
Grandes cosas suceden cuando los usuarios son socios en el proceso de desarrollo de software - Blog JMP escribió:
[...] vea una publicación de blog anterior que escribí sobre el webcast de Eric y el nuevo [...]
