A 新しく記録されたウェブキャストこれは、既存のエンバク品種の改良に焦点を当てた研究者のコンソーシアムの仕事を強調しています。記録されているウェブキャストには、米国農務省(USDA)の研究分子生物学者Eric Jackson博士による、世界規模の共同研究オーツリサーチエンタープライズ(CORE)の仕事に関する発表と、今後登場するいくつかの機能のデモが含まれていますに JMPゲノミクス 5.1この秋
の中にオンデマンドウェブキャスト Ericはマーカーによる育種技術について議論し、エンバクの穀物繊維を制御する新しい遺伝子の発見につながった研究を共有しています。COREチームは、複雑なオーツ麦ゲノムのマーカーに関する知識を向上させ、将来の繁殖プログラムで使用するための予測アッセイを開発するために、ハイスループットゲノミクスアプローチを使用しました。EricはJORE Genomicsを使って、COREの発見に貢献した分析をいくつか実行しました。
このWebキャストでは、JMPライフサイエンスのスペシャリスト、Jordan Hillerによる新しい組換えグループとリンケージグループ、リンケージマップの順序、およびリンケージマップビューアのプロセスについての発表も予定されています。
これらの新機能は、USDAを含むいくつかの大規模なJMP Genomicsライセンスサイトの要求に応じて追加されました。Ericのような新しい機能を実現するために協力してくれたユーザーの協力に感謝します。現在のワークフロー、実際のデータセットに関する情報を共有し、プロトタイプの改良のための提案をすることを望んでいる顧客と協力することは理想的な状況です。非常に多くのJMP Genomicsプロセスと同様に、これらの新しいツールは対話式の機能を組み合わせたものです JMP の処理能力を持つ SAS 舞台裏で。
私たちの新しい機能は、リンケージマップスペースにおけるユーザーの多くのニーズをカバーすると信じています。再結合および連鎖グループプロセスは、いくつかの一般的な種類の実験的交雑について再結合率を推定し、新しいマップを最初から構築するときに使用する連鎖グループの初期セットを決定します。既存の地図を視覚化することだけに興味があるなら、リンケージマップビューアの3Dグラフィックが好きです。
すでにコンセンサスリンケージグループが識別されている場合は、リンケージマップの順序でそれらを使用して、事前定義されたグループ内で順序を実行することができます。リンケージマップ順序は、PROC MDSの多次元尺度法を呼び出す標準のマーカー順序付けアルゴリズムを備えています。ただし、ラジオボタンをクリックするだけで、JMP Genomicsのユーザーもライセンスを取得できます。 SAS / OR SAS PROC OPTMODELの高度なマーカー順序最適化方法を利用できます。最後に、JMPのGraph Builderなどの対話型ツールを使用して、既存のマップとJMP Genomics内に構築された新しいマップとの間の順序を比較できます。
見た後 EricのWebキャストとJordanのデモ新しい機能についてのご意見をお聞かせください。来年度のJMP 10プラットフォームで来年リリースされるJMP Genomics 6の次期バージョンについては、この分野およびその他の分野で要件を集めています。夏の後半には、JMP Genomics 5.1の新機能に関するWebキャストを開催します。録画したWebキャストにコメントがある場合、または既存のユーザーで、今後のプレビューを見るのが待ちきれない場合は、までご連絡ください。 genomics@jmp.com 。
動植物ゲノム学会JMPゲノム解析書きました:
[...] USDA-ARSのJMPチャンピオンEric Jacksonとのコラボレーションのおかげで、そして我々のJMP Genomics開発チームの努力のおかげで、我々は急速な進歩を遂げました[...]
ユーザーがソフトウェア開発プロセスのパートナーであるとき、すばらしいことが起こります - JMP Blog 書きました:
[...] EricのWebキャストと新しいWebキャストについて書いた以前のブログ投稿をチェックしてください[...]