一個新錄製的網絡廣播現在可以在我們的網站上找到一個專注於改善現有燕麥品種的研究人員聯盟的工作。錄製的網絡廣播包括美國農業部(USDA)研究分子生物學家Eric Jackson博士關於全球協作燕麥研究企業(CORE)工作的演示,以及一些功能的演示在 JMP基因組學 5.1今年秋天。
在裡面點播網絡直播 ,Eric討論了標記輔助育種技術,並分享了導致發現控制燕麥穀物纖維的新基因的工作。CORE團隊使用高通量基因組學方法來提高複雜燕麥基因組中標記的知識,並開髮用於未來育種計劃的預測分析。Eric使用JMP Genomics進行了一些有助於CORE研究結果的分析。
此網絡廣播還包括JMP生命科學專家Jordan Hiller關於新的重組和鏈接組,鏈接地圖順序和鏈接地圖查看器流程的演示,這些流程將出現在我們即將發布的版本中。
應幾個大型JMP Genomics許可站點(包括USDA)的要求添加了這些新功能。我們非常感謝像Eric這樣願意與我們合作以實現這些新功能的用戶的合作。與願意分享當前工作流程,真實數據集的信息並為原型改進提出建議的客戶合作是一種理想的情況。像許多JMP基因組學過程一樣,這些新工具配對了互動功能 JMP 具有處理能力 SAS 在幕後。
我們相信我們的新功能可以滿足鏈接地圖空間中用戶的許多需求。重組和連鎖群過程可以估計幾種常見類型的實驗雜交的重組分數,並確定從頭開始構建新地圖時要使用的初始連鎖群組。如果您只想對現有地圖進行可視化,那麼您一定會喜歡Linkage Map Viewer的3D圖形。
如果已經識別出共識鏈接組,則可以使用“鏈接映射順序”中的鏈接組在預定義組中執行排序。Linkage Map Order具有標準的標記排序算法,可在PROC MDS中調用多維縮放方法。但是,通過單擊單選按鈕,JMP Genomics用戶也可以獲得許可 SAS / OR 可以利用SAS PROC OPTMODEL中的高級標記順序優化方法。最後,您可以使用JMP中的Graph Builder等交互式工具來比較現有地圖與JMP Genomics中構建的新地圖之間的順序。
看完之後 Eric的網絡直播和Jordan的演示 ,請告訴我們您對新功能的反饋。我們正在收集下一版JMP Genomics 6的這一領域和其他領域的需求,該版本將於明年在即將推出的JMP 10平台上發布。我們將在夏季晚些時候為JMP Genomics 5.1舉辦新的網絡直播。如果您對錄製的網絡廣播有評論,或者是現有用戶,並且迫不及待地預覽即將發布的內容,請通過以下方式與我們聯繫: genomics@jmp.com 。
植物和動物基因組會議的JMP基因組學中寫道:
[...]感謝與JMP冠軍EricJ合作的USDA-ARS,以及我們JMP Genomics開發團隊的努力,我們取得了快速進展[...]
當用戶是軟件開發過程的合作夥伴時,很棒的事情發生 - JMP博客中寫道:
[...]查看我之前撰寫的關於Eric的網絡廣播和新[...]的博客文章。