Mon brassard BodyMedia® FIT® utilise divers capteurs pour surveiller mes mouvements, notamment un accéléromètre et un gyroscope. Lorsqu'elles sont connectées à un ordinateur via USB ou connectées via Bluetooth à un iPhone, les données stockées sur mon appareil sont téléchargées sur des serveurs BodyMedia® et un algorithme s'exécute pour déterminer à quel moment j'étais actif, couché, éveillé ou en veille pour chaque minute de surveillance. . Je reçois une estimation de combien de temps j'ai dormi, et je peux visualiser une visualisation minute par minute du temps que j'ai passé allongé, éveillé et endormi. (Vous pouvez obtenir plus de détails sur l’algorithme de classification du sommeil de BodyMedia dans papier blanc .) Je peux extraire les données de ces résumés de sommeil quotidiens des fichiers de résumé d’activité, comme je l’ai décrit dans précédent article de blog .
Je voulais analyser et créer des visualisations de données efficaces de mes données de sommeil. Une des premières versions de mon affiche électronique JMP Discovery Summit comprenait un nuage de points multidimensionnel indiquant la durée du sommeil, son efficacité et le temps passé au lit pendant environ 1 300 nuits. J'ai coloré les points en rouge indiquant les nuits avec des durées de sommeil inférieures à 4 heures. Étant donné que je dors rarement aussi peu d'heures, je soupçonnais que certaines ou la totalité de ces valeurs aberrantes étaient rarement des erreurs de collecte de données. Par ailleurs, je savais que la journée de sommeil la plus longue était une mesure précise d'un récent accès de grippe de l'estomac!

Au moment où j'ai rencontré Xan Gregg , développeur en chef de Graph Builder et responsable du groupe JMP Data Visualization, je suis passé à l’utilisation de graphiques à parcelles pour visualiser mes données de sommeil. La vue en boîte à moustaches raconte une histoire beaucoup plus intéressante puisqu'elle montre des données sur une période donnée et me donne une meilleure idée de la variabilité de mes mesures de sommeil en quelques mois. De plus, l'ajout d'une dimension temporelle a clairement montré que la forte baisse de mon efficacité en matière de sommeil à la fin du mois de septembre 2011 coïncidait parfaitement avec la naissance de mon fils!
Lorsque j'ai montré ce graphique à Xan, il a recommandé:
Alléger les couleurs utilisées dans les boîtes à moustaches.Assombrir les lignes plus lisses.Ajouter des annotations pour signaler des tendances importantes.Changer mes étiquettes d'axe X en orientation horizontale.Nous avons tous deux pensé que la version finale de mon graphique du sommeil était plus attrayante et plus facile à interpréter.

J'ai été surpris de voir à quel point mes habitudes de sommeil variaient avec la période de l'année, comme le montrent les diagrammes en boîte et les courbes montantes et descendantes de la ligne la plus lisse dans le graphique de la durée du sommeil en bas. Contrairement à mes mesures d'activité, qui, je le sais, sont fortement affectées par le fait que je porter mon brassard moins pendant la journée en été , Je porte mon brassard au lit presque sans faute. La variation saisonnière des habitudes de sommeil est en fait un phénomène communément reconnu dans le sommeil humain, mais je l'avais complètement manqué jusqu'à présent dans mes propres données! Cette tendance n'était pas évidente lorsque j'ai consulté les rapports de synthèse standard de mes informations de sommeil en quelques jours, semaines et mois.
Il est facile de voir à quel point des données à long terme sur les habitudes de sommeil nocturnes pourraient être utiles en cas de fatigue chronique. Bien qu’elle puisse ne pas être aussi précise qu’une étude de sommeil réalisée par un professionnel de la santé, accumuler des données nocturnes sur une longue période avec un appareil de surveillance du sommeil peut vous aider à évaluer la quantité de sommeil dont vous avez besoin pour vous sentir reposé. Si vous avez une insomnie, vous pouvez utiliser vos données de sommeil pour savoir quand et combien de temps vous êtes éveillé la nuit. Si vous combattez la somnolence pendant la journée, vous pouvez modifier votre comportement de différentes manières et en évaluer les conséquences sur votre sommeil.
Les experts recommandent diverses stratégies d’amélioration du sommeil, telles que couper ou limiter la caféine, aller au lit plus tôt, se lever au réveil au lieu de se mettre en sommeil à plusieurs reprises, ajouter de l’exercice à la journée et éviter l’utilisation d’écrans proches de l'heure du coucher. La surveillance du sommeil vous fournit des données sur les résultats réels pour déterminer laquelle de ces stratégies peut vous aider à optimiser vos propres habitudes de sommeil. Certains moniteurs de sommeil peuvent même vous réveiller à un moment optimal compte tenu de votre cycle de sommeil. Depuis que je surveille mon sommeil, j’ai rarement eu recours à une alarme matinale. Au réveil, j'évalue si je suis toujours fatigué et, dans le cas contraire, je vérifie combien d'heures j'ai dormi. Si je pense avoir suffisamment dormi en me basant sur ces deux évaluations, je me lève et commence ma journée.
En examinant mon journal alimentaire et mes données sur le sommeil, j'ai découvert qu'en plus des variations saisonnières, plusieurs autres facteurs semblent affecter la qualité de mon sommeil. Je dors beaucoup moins quand je suis stressé au travail et quelques jours sans exercice peuvent nuire à mon sommeil. Quoi et quand je mange peut aussi affecter ma qualité de sommeil. J'ai observé que le coup de fouet stimulant fourni par le yogourt grec au chocolat (mon petit-déjeuner préféré) perturbe mon sommeil si je le mange comme collation du soir. Peut-être en raison de ma formation en biochimie et en génomique, je ne me suis pas contenté d’observer ce lien. J'avais pris l'habitude de boire de la caféine tard dans la nuit sans avoir un impact aussi négatif sur mon sommeil, alors je me demandais ce qui était différent ici? J'ai lu des articles sur le cacao en poudre et il s'avère qu'il contient de la caféine et un stimulant apparenté appelé théobromine. La même voie cellulaire désactive ces deux produits chimiques et, d’autres résultats de test, je sais que la forme lente d’une enzyme majeure est impliquée. Je soupçonne que lorsque je mange du yogourt grec au chocolat vers l’heure du coucher, je ne parviens pas à métaboliser suffisamment de produits chimiques stimulants qu’il contient avant de me coucher et, par conséquent, je dors mal toute la nuit.
Pour reproduire mon graphique de sommeil avec vos propres données dans Graph Builder, ouvrez un tableau de données contenant la mesure de la durée et / ou de l'efficacité du sommeil au format hr: m par date. Si votre table de données ne contient pas de variables Année et Mois, vous pouvez les créer à partir de la variable Date de votre table en cliquant dessus avec le bouton droit de la souris dans le sélecteur de variable Graph Builder et en ajoutant de nouvelles colonnes de transformation à partir du menu Date / Heure. J'ai utilisé une propriété Value Ordering sur la variable Month pour créer une colonne Month Name et je me suis assuré que Year et Month Name étaient spécifiés en tant qu'Ordinal.
Pour créer le graphique, ouvrez Graph Builder et faites glisser:
Année à l'axe des X.Nom du mois sur l'axe X (juste au-dessus de l'année, l'axe indique donc le nom du mois imbriqué dans l'année).Efficacité du sommeil sur l'axe des ordonnées.Durée de sommeil sur l’axe des Y situé juste en dessous de l’efficacité du sommeil afin qu’elles apparaissent dans des sections distinctes.Pour compléter le graphique, définissez le type d'élément sur Boîte à moustaches à l'aide de l'icône en haut de la fenêtre, ajustez votre axe Y, le titre du graphique et les titres des axes si vous le souhaitez, puis ajoutez une ou plusieurs annotations dans le menu Outils. Vous pouvez cliquer avec le bouton droit sur les annotations pour modifier leur apparence afin de correspondre à votre graphique, comme je l'ai fait. Restez à l'écoute pour les prochains articles où Xan et moi montrerons comment il a contribué à améliorer d'autres visualisations de mes données!
Vous pouvez en apprendre plus sur mes intérêts en matière d'analyse quantifiée de données personnelles dans cet article de blog ici , consultez un e-poster sur mon projet d'importation de données de journal d'activité dans la communauté d'utilisateurs JMP Discovery Summit 2014 ici , et découvrez comment j'ai importé mes fichiers de résumé d'activité BodyMedia® à partir d'Excel ici et des fichiers du journal des aliments à partir de texte ici . J'ai utilisé JMP pour recoder les noms des aliments et classer les aliments en catégories , puis utilisé mes données pour caractériser mon activité et enregistrement des repas modèles. Vous pouvez télécharger un complément JMP à partir de l’échange de fichiers JMP. ici d'importer vos propres fichiers de résumé d'activité BodyMedia® et vos fichiers de journal des aliments ou des fichiers de journal des aliments au format CSV à partir du site Web gratuit MyFitnessPal.